Biophysique des interactions macromoléculaires
Animateurs
Elisabeth LE RUMEUR (CNRS UMR 6026), Franck ARTZNER et Véronique VIÉ (Institut de Physique), Saïd BOUHALLAB (Inra STLO)
Présentation et objectifs
Ce thème transversal entre l'IFR 140 et l'Institut de Physique a pour objectif de diffuser et développer les techniques de biophysique classiques et récentes pour l'étude de la structure des macromolécules biologiques et leurs interactions.
La structure moléculaire des biomolécules et de leurs assemblages complexes est un enjeu majeur pour la compréhension de leurs fonctions biologiques et/ou physiques. En effet, la connaissance des mécanismes de formation de ces assemblages et des interactions mises en jeu est une étape clef nécessaire à la compréhension des fonctions des nombreux gènes mis en évidence dans le cadre de la génomique. Pour aller encore plus loin dans l'analyse de ces fonctions fondamentales, il est important de résoudre la structure des biomolécules et de comprendre leurs modalités d'interactions et d'assemblage du niveau moléculaire au niveau cellulaire. Cela implique de connaître les techniques disponibles à la fois dans leurs possibilités et leurs limites ainsi que leurs complémentarités.
L'objectif de ce thème transversal est d'apporter des éléments concrets sur les possibilités méthodologiques pour l'étude structurale des macromolécules et de leurs interactions au niveau moléculaire. Ainsi, ce groupe n'est pas ancré dans une problématique biologique précise mais a plutôt comme vocation de réfléchir, d'échanger et de faire partager les expériences d'études de structure et d'interactions moléculaires, protéine-protéine, protéine-lipide, protéine-acides nucléiques.
Nous abordons les projets par une approche multiéchelle avec les techniques macroscopiques que sont la fluorescence, le dichroïsme circulaire, la calorimétrie et les spectroscopies IR et Raman, les techniques de microscopies en champ proche AFM et les techniques atomiques RMN et RX. L'idée est de donner une vision d'ensemble des techniques et de ce qu'elles peuvent apporter de complémentaire aux études de biologie cellulaire et moléculaire.
Il existe sur Rennes un ensemble de compétences dans ce domaine réunies à l'échelle régionale dans un GIS Biophysique dont les animateurs font partie. Ce thème transversal est à l'évidence adossé au GIS.
En outre, ce projet fait miroir avec l'axe transversal de l'Institut de Physique et Ingéniérie (IPI) intitulé « Physique du vivant » où l'objectif est d'utiliser les concepts de la physique pour expliquer des phénomènes biologiques en particulier dans la mécanique. Ces deux approches sont complémentaires et s'enrichiront l'une l'autre.
La plate-forme PRISM de l'IFR140 qui réunit des appareillages de RMN haute résolution est ainsi concernée ainsi que la plate-forme "Spectroscopies" qui réunit un équipement en fluorescence stationnaire et un spectromètre de dichroïsme circulaire.